中国神经再生研究(英文版) ›› 2019, Vol. 14 ›› Issue (4): 632-641.doi: 10.4103/1673-5374.247467
Li-Xiang Yang 1 , Li-Kun Yang 1 , Jie Zhu 1 , Jun-Hui Chen 1 , Yu-Hai Wang 1 , Kun Xiong 2
摘要:
长链非编码RNA(lncRNA)在颅脑疾病中可发挥重要作用,但是在人类创伤性脑损伤(TBI)组织中的表达谱仍不清楚。为此,研究纳入解放军第101医院3例(36岁男性1例,52岁及49岁女性各1例)被诊断为创伤性脑损伤并接受脑挫伤清除手术患者的损伤脑组织,将此3例患者脑挫伤部位周围组织设为对照,以此观察人类创伤性脑损伤组织长非编码RNA和mRNA的表达特征。(1) Volcano Plot filtering检测发现,两组额颞部组织具有差异表达的99个lncRNAs和63个mRNAs(P < 0.05,fold change > 1.2);(2)基因芯片检测显示,两组发现43个lncRNAs表达上调,56个lncRNAs表达下调,59个mRNA表达上调,4个mRNA表达下调;(3) GO及KEGG分析发现,27种信号通路与靶基因有关,特别是Legionellosis和Influenza A信号通路;(4)随后实验构建了lncRNA-基因网络,并发现12对lncRNA-mRNA的相关系数绝对值大于0.99;(5)最后,通过RT-qPCR法验证了在两组中所选上调最显著的5个mRNA的表达情况,这也与基因芯片检测结果一致;(6)上述数据说明,在人创伤性脑损伤组织和周围组织中,mRNA及LncRNA的表达谱均有显著差异,这为人类TBI中涉及LncRNAs的治疗提供了新的视野。本研究对象均签署知情同意书,并已在中国临床试验注册中心注册(注册号:ChiCTR-TCC-13004002),试验方案版本号1.0。
orcid: 0000-0002-3103-6028(Kun Xiong) 0000-0002-8076-6756(Yu-Hai Wang)